Štúdia identifikovala baktérie spojené s predčasným pôrodom

Výskumníci zo Štátnej univerzity v Severnej Karolíne zistili, že v tom istom vaginálnom mikrobióme môže koexistovať viacero druhov Gardnerella, baktérií niekedy spojených s bakteriálnou vaginózou (BV) a predčasným pôrodom. Zistenia publikované v časopise mSystems prispievajú k rastúcemu chápaniu vplyvu Gardnerella na ľudské zdravie.

Gardnerella je skupina anaeróbnych baktérií, ktoré sa bežne vyskytujú vo vaginálnom mikrobióme. Zvýšené hladiny týchto baktérií sú charakteristickým znakom BV a sú spojené so zvýšeným rizikom predčasného pôrodu, ale vyskytujú sa aj u žien bez dôkazov o tomto ochorení.

„Snažili sme sa pochopiť rozmanitosť v rámci Gardnerelly,“ hovorí Ben Callahan, docent zdravia populácie a patobiológie na Štátnej univerzite v Severnej Karolíne a spoluautor článku.

„Vedci začali študovať jednotlivé druhy Gardnerelly len nedávno, takže zatiaľ nevieme, či rôzne druhy môžu mať rôzne účinky na zdravie. Naším hlavným cieľom bolo študovať ekológiu Gardnerelly.“

Unikátnou výzvou sekvenovania vaginálneho mikrobiómu je, že všetky vzorky sa skladajú predovšetkým z DNA hostiteľa, čo robí extrakciu mikrobiálnych údajov drahšou a náročnejšou na prácu. Prvou úlohou výskumného tímu bolo vyvinúť metodiku, ktorá by umožnila identifikáciu rôznych druhov Gardnerella z údajov o mikrobióme.

„Nástroje dostupné na štúdium vaginálneho mikrobiómu považujú všetky Gardnerelly za jeden druh,“ povedala Hannah Bermanová, postdoktorandka na North Carolina State University a hlavná autorka článku. „Aby sme mohli túto prácu vykonať, museli sme si vytvoriť vlastnú databázu genómov Gardnerelly a vyvinúť metódu na identifikáciu rôznych druhov Gardnerelly. Dúfajme, že to umožní aj viacerým výskumníkom študovať rozmanitosť Gardnerelly.“

Výskumný tím skúmal sekvenčné údaje z troch kohort: dvoch náhodných populácií tehotných žien a jednej populácie s anamnézou predčasného pôrodu. Analyzovali metagenomické sekvencie Gardnerella zo vzoriek, aby zistili, či existuje súvislosť medzi špecifickými druhmi Gardnerella a predčasným pôrodom.

Hoci nenašli „zásadný dôkaz“, urobili dva prekvapujúce objavy.

Najprv identifikovali medzi vzorkami potenciálny 14. druh Gardnerella – pred touto prácou bolo identifikovaných iba 13 druhov.

Zistili tiež, že vo väčšine vzoriek, ktoré obsahovali Gardnerellu, sa v tom istom mikrobióme vyskytovalo viacero druhov Gardnerelly: v jednotlivých vzorkách sa našli dva až všetkých 14 známych druhov Gardnerelly.

„Zvyčajne, ak nejaký druh baktérie kolonizuje prostredie, očakávame, že vylúči blízkych príbuzných, ktorí zaberajú rovnakú ekologickú niku a spotrebúvajú rovnaké zdroje,“ hovorí Callahan. „Často hovorím, že s baktériami je možné všetko, ale stále je to nezvyčajné. Videli sme tiež, že keď je celková mikrobiálna záťaž vyššia, Gardnerella tvorí väčšiu časť tejto záťaže.“

„Naďalej sa hromadia dôkazy o tom, že Gardnerella súvisí s predčasným pôrodom, ale detaily tohto vzťahu sú zložité. V tejto práci sme nenašli jeden škodlivý druh Gardnerella – možno sú škodlivé všetky. To však zďaleka nie je koniec príbehu.“

Výskumníci dúfajú, že sa budú môcť ďalej venovať otázkam koexistencie druhov a zloženia mikrobiómu.

„Vaginálny mikrobióm je podceňovaný,“ hovorí Callahan. „Napríklad často v ňom dominuje jeden druh Lactobacillus, ktorý vytvára prostredie, ktoré vylučuje iné baktérie. Keď ten zmizne, je tam Gardnerella. Ako teda tieto baktérie interagujú?“

„Odpovede na tieto otázky by mohli viesť k účinnejšej liečbe bakteriálnej vaginózy a k spôsobom predpovedania a prevencie predčasného pôrodu. Táto práca je v tomto procese dôležitým krokom.“