Vedci sa naučili rozpoznať chronickú únavu podľa stôp voľnej bunkovej RNA

Tím z Cornellovej univerzity preukázal, že jediná ampulka krvi môže poskytnúť „molekulárny odtlačok prsta“ myalgickej encefalomyelitídy/syndrómu chronickej únavy (ME/CFS). Sekvenovali bezbunkovú RNA (cfRNA) v plazme a trénovali modely strojového učenia, ktoré rozlišovali pacientov od zdravých (sedavých) jedincov s presnosťou ≈77 %. Tento vzorec naznačoval nesprávne fungujúci imunitný systém, „voľnú“ extracelulárnu matricu a príznaky únavy T-buniek, pričom obzvlášť výrazné boli plazmacytoidné dendritické bunky (PCDC) spojené s interferónovou odpoveďou. Práca bola publikovaná online 11. augusta 2025 v PNAS.

Pozadie štúdie

• Problém s absenciou „testov “. ME/CFS nemá žiadny spoľahlivý laboratórny test: diagnóza je založená na symptómoch (zhoršenie po námahe, „mozgová hmla“, poruchy spánku atď.) a vylúčení iných príčin. Z tohto dôvodu sa ľudia roky točia v kruhu – existuje len málo objektívnych markerov, na ktoré by sa lekár mohol „zamerať“.
• Vyzerá to na veľa vecí. Sťažnosti na ME/CFS sa prekrývajú s depresiou, anémiou, dysfunkciou štítnej žľazy, autoimunitnými a postinfekčnými stavmi a v posledných rokoch aj s dlhotrvajúcim COVIDom. Na rozlíšenie jedného od druhého je potrebný biologický odtlačok prsta.
• Prečo skúsili krv a cfRNA? Plazma obsahuje fragmenty RNA „zhodené“ bunkami rôznych orgánov – bezbunkovú RNA (cfRNA). Je to ako „čierna skrinka“ tela: súbory takýchto fragmentov sa dajú použiť na posúdenie, ktoré tkanivá a imunitné bunky sú aktivované, ktoré dráhy práve „vydávajú hluk“. Tento prístup sa už osvedčil pri iných zápalových a infekčných stavoch.
• Čo nám bráni vidieť signál? CFRNA je malá, krehká a pacienti s ME/CFS sú často neaktívni – samotná fyzická nečinnosť mení molekulárne pozadie. Preto je dôležité vybudovať dôkladný laboratórny postup (zber/ukladanie/sekvenovanie) a vybrať správne kontrolné skupiny (vrátane zdravých, ale neaktívny spôsob života).

Aký bol cieľ práce?

1. Pochopiť, či má ME/CFS v krvi pretrvávajúci podpis cfRNA.
2. Rozložte signál podľa zdrojov: ktoré bunky/tkanivá prispievajú.
3. Identifikujte biologické dráhy (imunitná dysregulácia, extracelulárna matrica, príznaky únavy T-buniek atď.), ktoré je možné testovať inými metódami.
4. Vytvorenie modelu strojového učenia, ktorý dokáže rozlíšiť ME/CFS od kontrolnej skupiny, je krokom k objektívnemu testu a budúcej stratifikácii pacientov.

Praktický význam

Ak sa podpis cfRNA potvrdí vo veľkých kohortách, bude produkovať:

• pomocný diagnostický nástroj (nie namiesto kliniky, ale na pomoc);
• základ pre podtypy ME/CFS (niektoré sú viac „pro-interferónové“, niektoré viac pro-matrixové/cievne atď.);
• cesta k cielenému výskumu a monitorovaniu reakcie na intervencie.

Myšlienka je jednoduchá: namiesto spoliehania sa iba na symptómy, prečítajte si z krvi systémový „záznam udalostí“ tela a extrahujte z neho rozpoznateľný profil ME/CFS.

Čo urobili?

• Odobrali krv skupine ľudí s ME/CFS a zodpovedajúcej skupine zdravých, ale neaktivných účastníkov (aby sa predišlo zámene účinkov ochorenia a nečinnosti). Z plazmy izolovali drobné fragmenty RNA, ktoré sa uvoľňujú pri poškodení a smrti buniek – akýsi denník toho, čo sa deje v tele. Potom ich sekvenovali a „naučili“ algoritmy na nájdenie vzorcov ochorenia. Výsledkom bolo viac ako 700 významne odlišných transkriptov medzi prípadmi a kontrolami.
• Pomocou génového podpisu výskumníci „dekonvoluovali“ cfRNA a zistili, ktoré bunky a tkanivá vysielajú signál. Rozdiely zistili v šiestich typoch buniek naraz, pričom na čele boli plazmacytoidné dendritické bunky, ktoré produkujú interferóny typu I (náznak predĺženej antivírusovej odpovede). Zmenili sa aj monocyty, krvné doštičky a podtypy T-buniek.
• Klasifikátor založený na cfRNA dosiahol presnosť ≈77 % – stále nízka hodnota pre hotový test, ale významný krok vpred smerom k objektívnej diagnostike ME/CFS.

Prečo je to dôležité?

• V súčasnosti neexistuje žiadny laboratórny test na ME/CFS – diagnóza je založená na kombinácii symptómov (silná únava, zhoršenie po námahe, „mozgová hmla“, poruchy spánku atď.), ktoré sa dajú ľahko zameniť s inými ochoreniami. „Molekulárny odliatok“ krvi by mohol lekárom poskytnúť výhodu – aspoň ako pomocný nástroj na začiatku.
• Tento prístup je škálovateľný: tá istá skupina inžinierov už použila cfRNA na pomoc pri diferenciácii Kawasakiho choroby, MIS-C, bakteriálnych a vírusových infekcií u detí – to znamená, že ide o univerzálnu platformu pre komplexné diagnózy.
• Pre vedu o ME/CFS je to krok smerom k biomarkerom mechaniky ochorenia: interferónová os, vyčerpanie T-buniek, narušenie matrice – to všetko je možné testovať inými metódami a integrovať s proteomikou/metabolomikou. V tejto oblasti sa už zhromažďujú podobné „kúsky skladačky“ (napr. úloha oxidačného stresu a cirkulujúcich mikroRNA) a cfRNA pridáva pohľad zhora nadol na systém.

Detaily, ktoré upútajú pozornosť

• >700 diferenciálnych transkriptov a zameraní na dráhy imunitnej dysregulácie, organizácie extracelulárnej matrice a vyčerpania T-buniek nie sú len diagnostikou áno/nie, ale náznakmi biológie procesu.
• Zvýšenie signálu z plazmacytoidných dendritických buniek (hlavných producentov IFN-I) je v súlade s hypotézou o predĺženej antivírusovej alebo „chybnej“ imunitnej odpovedi u niektorých pacientov.
• Tím zdôrazňuje, že rozlíšenie ME/CFS od dlhého COVIDu pomocou cfRNA je potenciálne uskutočniteľné a je logickým ďalším krokom vzhľadom na prekrývanie symptómov a ich mechanizmov.

Kde je opatrnosť?

• Toto nie je hotová analýza „z kliniky“. Presnosť 77 % je dobrý začiatok, ale pred klinikou sú potrebné veľké, heterogénne kohorty, externá validácia, porovnanie s inými únavovými ochoreniami a definovanie štandardov pred analýzou (ako odoberať/skladovať krv).
• Kontrolnou skupinou sú zdraví ľudia so sedavým spôsobom života; je dôležité overiť, ako model funguje v reálnych diferenciálnych diagnózach v ambulancii (depresia, anémia, ochorenie štítnej žľazy, autoimunitné a postinfekčné syndrómy atď.).
• cfRNA je „súhrnom“ celého tela; je citlivá, ale aj nejednoznačná. Preto sa interpretácia musí opierať o nezávislé dátové osi (proteomika, imunoprofilovanie, klinické).

Čo bude ďalej?

• Rozšírte súbor údajov a spresnite model na klinické metriky (AUC/senzitivita/špecificita) v multicentrických kohortách.
• Korelovať signály cfRNA so závažnosťou symptómov a dynamikou po cvičení s cieľom priblížiť sa k stratifikácii pacienta.
• Integrácia cfRNA s už nahromadenými „omikami“ u ME/CFS a dlhého COVIDu je cestou k objektívnemu subtypovaniu a cieleným intervenciám.

Záver

Bezbunková RNA sa stala „čiernou skrinkou“ tela: jej vzorce v krvi sa dajú použiť na videnie podpisu ME/CFS, nielen na vypočutie symptómov. Zajtra nebude žiadny diagnostický test, ale smer je jasný: jedna skúmavka – veľa biológie a lekári budú mať šancu prestať slepo „cítiť sa ako sloni“.