Štúdia nachádza baktérie spojené s predčasným pôrodom

Výskumníci zo Štátnej univerzity v Severnej Karolíne zistili, že viaceré druhy Gardnerella, baktérie niekedy spojené s bakteriálnou vaginózou (BV) a predčasným pôrodom, môžu koexistovať v tej istej vagíne. Mikrobiálna flóra. Zistenia publikované v žurnálu mSystems prispievajú k rastúcemu chápaniu vplyvu Gardnerella na ľudské zdravie.

Gardnerella je skupina anaeróbnych baktérií, ktoré sa bežne vyskytujú vo vaginálnom mikrobióme. Zvýšené hladiny týchto baktérií sú charakteristickým znakom BV a sú spojené so zvýšeným rizikom predčasného pôrodu, ale vyskytujú sa aj u žien bez dôkazu ochorenia.

"Snažili sme sa pochopiť rozmanitosť v rámci Gardnerella," hovorí Ben Callahan, odborný asistent populačného zdravia a patobiológie na Štátnej univerzite v Severnej Karolíne a spoluautor článku.

"Vedci len nedávno začali študovať jednotlivé druhy Gardnerella, takže zatiaľ nevieme, či môžu mať rôzne druhy rôzne zdravotné účinky. Naším hlavným cieľom bolo študovať ekológiu Gardnerella."

Jedinečnou výzvou pri sekvenovaní vaginálneho mikrobiómu je to, že všetky vzorky sa primárne skladajú z hostiteľskej DNA, vďaka čomu je extrahovanie mikrobiálnych údajov drahšie a časovo náročnejšie. Prvou úlohou výskumného tímu bolo vyvinúť metodológiu na identifikáciu rôznych druhov Gardnerella z údajov o mikrobiómoch.

"Súčasné nástroje na štúdium vaginálneho mikrobiómu zaobchádzajú so všetkými Gardnerella ako s jedným druhom," hovorí Hannah Berman, postdoktorandka na Štátnej univerzite v Severnej Karolíne a hlavná autorka článku. "Na vykonanie tejto práce sme museli vybudovať vlastnú databázu genómov Gardnerella a vyvinúť metódu na identifikáciu rôznych druhov Gardnerella. Dúfajme, že to tiež umožní viacerým výskumníkom študovať rozmanitosť Gardnerella."

Výskumný tím skúmal sekvenčné údaje z troch kohort: dvoch náhodných populácií tehotných žien a jednej populácie s predčasným pôrodom v anamnéze. Analyzovali metagenomické sekvencie Gardnerella zo vzoriek, aby zistili, či existuje spojenie medzi konkrétnym druhom Gardnerella a predčasným pôrodom.

Hoci dymiacu zbraň nenašli, urobili dva prekvapivé objavy.

Najprv identifikovali medzi vzorkami potenciálny 14. Druh Gardnerella – pred touto prácou bolo identifikovaných iba 13 druhov.

Zistili tiež, že vo väčšine vzoriek, ktoré mali Gardnerella, viacero druhov Gardnerella koexistovalo v tom istom mikrobióme: v jednotlivých vzorkách sa našli dva až všetkých 14 známych druhov Gardnerella.

"Ak druh baktérie kolonizuje životné prostredie, zvyčajne očakávame, že vylúči blízkych príbuzných, ktorí by zaberali rovnaké ekologické miesto a spotrebovávali rovnaké zdroje," hovorí Callahan. "Často hovorím, že s baktériami je možné všetko, ale stále je to nezvyčajné. Tiež sme videli, že keď je celková mikrobiálna záťaž vyššia, Gardnerella tvorí veľkú časť tejto záťaže."

"Stále pribúdajú dôkazy o tom, že Gardnerella je spojená s predčasným pôrodom, ale podrobnosti o vzťahu sú zložité. V tejto práci sme nenašli jeden škodlivý druh Gardnerella – je možné, že všetky sú škodlivé. To nie je koniec príbehu." p>

Výskumníci dúfajú, že budú ďalej študovať otázky koexistencie druhov a zloženia mikrobiómov.

"Vaginálny mikrobióm je podceňovaný," hovorí Callahan. "Napríklad v ňom často dominuje jeden druh Lactobacillus, ktorý vytvára prostredie, ktoré vylučuje iné baktérie. Keď tam nie je, je tam Gardnerella. Ako teda tieto baktérie interagujú?

"Odpovede na tieto otázky by mohli viesť k efektívnejšej liečbe BV a spôsobom, ako predvídať a predchádzať predčasnému pôrodu. Táto práca je dôležitým krokom v tomto procese."