Nová metóda umožní rýchlejší vývoj liekov

Medzinárodná skupina vedcov z Francúzska, Ameriky a Ruska vyvinula novú unikátnu metódu na tvorbu liekov, ktorá sa svojou rýchlosťou líši od tých, ktoré existujú dnes. Vďaka novej metóde modelovania interakcií medzi proteínmi bude možné urýchliť proces vývoja vakcín a liekov a biochemici budú mať tiež nový potenciál pre vykonávanie výskumu.

Vedci teraz čelia úlohe vyvinúť také lieky, ktoré by nespôsobovali vedľajšie účinky, boli by úplne absorbované telom a ničili by iba nezdravé bunky. Pre bunku je proteín hlavným stavebným materiálom, v jednej bunke prebieha veľa interakcií (stovky tisíc) a štúdium týchto procesov umožní vedcom vyvinúť nové metódy liečby nebezpečných chorôb, vytvoriť nové biologické materiály pre vynález liekov.

Špecialisti z rôznych krajín pod vedením profesora Dmitrija Kozakova zo Stony Brook University dokázali vytvoriť a študovať počítačový model, ktorý je schopný niekoľkonásobne rýchlejšie vypočítať štruktúry vytvorené počas interakcie dvoch proteínov (nový model je desiatkykrát rýchlejší ako podobné systémy, ktoré existujú dnes).

Podľa vedcov sú laboratórne štúdie pomerne drahé, pretože vyžadujú činidlá a drahé vybavenie. Pre malé výskumné skupiny je najlepšou možnosťou počítačové modelovanie. V súčasnosti existuje mnoho počítačových systémov, ktoré vypočítavajú interakcie medzi proteínmi, ale bohužiaľ nie všetky existujúce systémy dokážu vypočítať veľký počet proteínových interakcií v krátkom čase. Všetky v súčasnosti používané algoritmy monitorujú konfigurácie samostatne, bez ich kombinácie, a nová metóda tímu profesora Kozakova umožňuje analyzovať všetky komplexy súčasne v krátkom čase, čo umožňuje zrýchliť proces až 100-násobne bez ovplyvnenia kvality konečného výsledku.

Použitím počítačového modelu ako základu budú špecialisti schopní nielen rýchlejšie vyvíjať lieky, ale aj výrazne znížiť ich náklady. Nová metóda počítačového modelovania umožňuje nielen vypočítať interakcie proteínov, ale aj analyzovať štruktúru živých organizmov (živočíchov aj ľudí). Podľa odborníkov nová metóda umožní vyvinúť účinné lieky na HIV a onkologické ochorenia a v krátkom čase bude možné pripraviť dostatočný počet liekov.

Vedci publikovali článok s výsledkami svojej práce v jednom z vedeckých časopisov, v ktorom špecialisti podrobne opísali novú metódu počítačového modelovania proteínových interakcií.

Táto práca nie je určená na komerčné použitie, ale ide o základnú štúdiu, takže o vykonanej práci môžeme hovoriť od okamihu jej publikovania vo vedeckej publikácii. Nový algoritmus sa už používa na verejnom serveri ClusPro ako nový výpočtový systém a je dostupný pre všetkých.

[ 1 ], [ 2 ], [ 3 ], [ 4 ]