Analýza odhaľuje nové dôkazy globálneho nárastu streptokokových infekcií skupiny A

Streptokok skupiny A (Strep A) je bežný typ baktérie, ktorá bežne spôsobuje infekcie hrdla a šarlach štýl>. Hoci väčšina infekcií je mierna, v zriedkavých prípadoch môže Strep A spôsobiť invazívne infekcie, ktoré môžu byť smrteľné.

V rokoch 2022 až 2023 zaznamenali zdravotnícke služby na celom svete prudký nárast závažných invazívnych infekcií Strep A po zrušení pandemických obmedzení. Nová štúdia vedcov z Imperial College London a Agentúry pre verejné zdravie Spojeného kráľovstva potvrdila, že kľúčovú úlohu v tomto náraste zohral bakteriálny variant s názvom M1UK.

Je známe, že kmene M1 spôsobujú invazívnejšie infekcie v porovnaní s inými typmi Strep A. Hoci tento variant bol prvýkrát identifikovaný a sekvenovaný v Spojenom kráľovstve, M1UK sa nedávno spájal s nárastom závažných infekcií v Európe, Austrálii a Severnej Amerike. A Japonskom po zrušení pandemických obmedzení. Bol tiež nájdený v Južnej Amerike, na Novom Zélande a na Taiwane.

Nízka miera infekcií Strep A počas pandémie pravdepodobne spôsobila, že populácia, najmä deti, sú obzvlášť zraniteľné voči týmto infekciám, čo prispieva k nárastu prípadov v mnohých krajinách.

V novej štúdii o genetike M1UK, publikovanej v Nature Communications, vedci poskytujú nové údaje o tom, kedy sa tento variant prvýkrát objavil a ako sa porovnáva s inými kmeňmi.

Globálna distribúcia a potenciálne introdukcie M1UK a prechodných populácií. Fylogenetický strom 2364 kmeňov M1UK a prechodných kmeňov zozbieraných na celom svete od marca 2005 do júla 2023. B Zjednodušený strom prenosu vytvorený pomocou PastML, ktorý ukazuje umiestnenie pôvodu epidémie predkov línií M1UK a prechodných populácií. C Odhad efektívnej veľkosti populácie (Ne) M1UK v Spojenom kráľovstve v priebehu času. Nature Communications (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-47929-7

Pomocou genetického sekvenovania vzoriek pacientov v kombinácii s počítačovým modelovaním zistili, že M1UK sa pravdepodobne objavil okolo roku 2008 a od roku 2010 sa začal postupne zvyšovať.

V porovnaní s predchádzajúcimi kmeňmi M1, ktoré sa za posledných 40 rokov relatívne nezmenili, produkuje M1UK viac toxínov, ktoré spôsobujú šarlach.

Profesor Shiranee Sriskandan z oddelenia infekčných chorôb na Imperial College London, ktorý viedol štúdiu s kolegami z UKHSA, povedal: „Baktérie sa vyvíjajú v priebehu času, a pretože Strep A je výlučne ľudský patogén, získava genetické zmeny. Šíri cez obyvateľstvo. Väčšina variantov časom prichádza a odchádza, zdá sa však, že M1UK sa teraz udomácnil v Spojenom kráľovstve a ďalších krajinách. Či to tak zostane z dlhodobého hľadiska, nie je známe.“

Genetická história

Pomocou prehľadávania globálnych genómových databáz tím ukázal, že keď bol M1UK prvýkrát objavený v Spojenom kráľovstve v roku 2019, z genómových sekvencií mimo Spojeného kráľovstva bolo možné identifikovať iba dva kmene M1UK. Ale následná analýza z iných krajín skúmajúca meniace sa trendy v infekciách Strep A (vrátane invazívnych infekcií) ukazuje, že M1UK je teraz prítomný vo viac ako 10 krajinách po celom svete a v niektorých prípadoch sa stal dominantným kmeňom v období po pandémii. p>

Analýza tiež poukazuje na prekážkový efekt, pri ktorom počas pandémie COVID-19 poklesli infekcie Strep A, čo sa zhoduje s rozsiahlymi opatreniami na sociálne dištancovanie a blokádami. Po tomto období sa však M1UK v Spojenom kráľovstve rýchlo rozšírila, pričom v roku 2022 sa výrazne zvýšil počet prípadov šarlach a invazívnych infekcií Strep A.

Podľa vedcov, hoci znížený prenos Strep A počas pandémie mohol viesť k oslabeniu imunity v populácii, ich práca zdôrazňuje genetické vlastnosti M1UK, ktoré naznačujú výhodu životaschopnosti oproti iným kmeňom, čo umožňuje jeho ľahšie šírenie a potenciálne spôsobiť závažnejšie ochorenia. Choroby. Je možné, že zvýšená imunita populácie voči kmeňu M1UK môže umožniť objavenie sa iných typov kmeňov.

Profesor Sriskandan, tiež klinický riaditeľ Centra pre biológiu bakteriálnej rezistencie, dodal: „Hoci už vieme, že za významný nárast prípadov minulú zimu bol zodpovedný variant M1UK, došlo k tomu v nezvyčajnom ročnom období, ktoré sa zhodovalo s respiračné vírusy a zimný stres. Čo všetko prispelo k závažnosti. V konečnom dôsledku, prudké nárasty, ktoré vidíme v rôznych obdobiach po celom svete, sú pravdepodobne spôsobené zníženou imunitou voči určitým respiračným patogénom, najmä Strep A. Vakcíny by tomu mohli pomôcť zabrániť a my skutočne potrebujeme vakcínu proti Strep A. Tieto najnovšie zistenia Náš výskum bol umožnila úzka spolupráca medzi výskumníkmi infekčných chorôb z Imperial College a popredným svetovým systémom molekulárneho dohľadu Agentúry pre verejné zdravie Spojeného kráľovstva.“