Štúdia: Gény ovplyvňujú protirakovinovú účinnosť ovocia a vlákniny

Nedávna štúdia publikovaná v časopise eBioMedicine identifikovala genetické variácie, ktoré môžu zmeniť súvislosť medzi príjmom vlákniny, ovocia a zeleniny a rizikom kolorektálnej rakoviny ( CRC). Vedci úspešne identifikovali dva významné lokusy, ktoré zmierňujú súvislosť medzi príjmom vlákniny a ovocia a rizikom CRC.

CRC je jedným z najbežnejších druhov rakoviny na svete s takmer dvoma miliónmi nových prípadov a viac ako 900 000 úmrtiami v roku 2020. Uvádza sa, že vysoký príjem ovocia, zeleniny, celozrnných výrobkov a vlákniny znižuje riziko CRC. Hoci existujú silné dôkazy o súvislosti medzi rizikom KRCa a konzumáciou celozrnných výrobkov a vlákniny, dôkazy o súvislosti medzi rizikom KRCa a príjmom ovocia a zeleniny zostávajú obmedzené.

Predchádzajúce celogenómové asociačné štúdie (GWAS) dokázali identifikovať najmenej 200 lokusov spojených s rizikom CRC, čo vysvetľuje až 35 % dedičnosti. Hoci interakcie medzi génom a prostredím (G × E) môžu vysvetliť dodatočnú dedičnosť, predchádzajúce štúdie s malými vzorkami a tradičnými metódami našli len obmedzený počet významných interakcií. Nové štatistické prístupy, ako sú spojené testy a dvojkrokové metódy, ktoré uprednostňujú jednonukleotidové polymorfizmy (SNP), môžu potenciálne zlepšiť presnosť týchto analýz.

Do analýzy bolo zahrnutých až 45 štúdií z troch genetických konzorcií CRC vrátane jedincov európskeho pôvodu. Štúdie zahŕňali kontroly prípadov pre kohortové štúdie a kontroly bez rakoviny pre štúdie prípadovej kontroly. Celkovo bolo analyzovaných 69 599, 69 734 a 44 890 účastníkov na príjem ovocia, zeleniny a vlákniny. Diétny príjem sa hodnotil pomocou dotazníkov o frekvencii jedla a histórie stravovania, zvyčajne vyjadrené ako porcie za deň pre ovocie a zeleninu a gramy za deň pre celkovú vlákninu.

Údaje boli harmonizované a vyjadrené ako kvartily podľa pohlavia a štúdie. Okrem toho kontrola kvality genotypizácie zahŕňala kontrolu chýbajúcich údajov, Hardyho-Weinbergovej rovnováhy a nekonzistentnosti pohlavia, po ktorej nasledovala imputácia a filtrovanie frekvencie a presnosti menších alel, čo viedlo k analýze 7 250 911 SNP.

V porovnaní s kontrolami boli účastníci s CRC starší, mali vyšší index telesnej hmotnosti a príjem energie a vyššiu prevalenciu rizikových faktorov, ako je rodinná anamnéza CRC a diabetes 2. Typu. V porovnaní s kontrolnou skupinou tiež konzumovali menej vlákniny, ovocia a zeleniny. Metaanalýzy zistili inverznú súvislosť medzi príjmom vlákniny (relatívne riziko na kvartilový nárast (OR) = 0,79), ovocia (OR = 0,79) a zeleniny (OR = 0,82) a rizikom KRCa.

Test 3-DF identifikoval lokus rs4730274 proti smeru génu SLC26A3, ktorý ukazuje súvislosť s príjmom vlákniny a interakciu s rizikom CRC. Stratifikácia podľa genotypu ukázala silnejšiu inverznú asociáciu medzi vláknom a CRC pre každú kópiu T alely. Funkčná anotácia naznačuje aktivitu zosilňovača v tkanive hrubého čreva s eQTL pre gén DLD.

Lokus rs1620977 v blízkosti génu NEGR1 vykazoval významnú súvislosť s konzumáciou ovocia a miernou interakciou s rizikom CRC. Silné inverzné asociácie boli pozorované so zvyšujúcou sa konzumáciou ovocia pre každú kópiu alely G.

Štúdia je doteraz najväčšou G × E štúdiou, v ktorej výskumníci identifikovali dve interakcie medzi príjmom vlákniny a ovocia a rizikom CRC. Najmä rs4730274 v blízkosti génu SLC26A3 naznačuje významnú súvislosť medzi príjmom vlákniny, funkciou čriev, zápalom a CRC. Výsledky si vyžadujú ďalší výskum na preskúmanie klinických dôsledkov a potvrdenie týchto zistení v rôznych populáciách.