HCV genóm obsahuje kladne nabitú jednovláknové RNA, ktorá kóduje štruktúrny 3 (nukleokapsidový proteín jadra a nukleoproteíny E1-E2 obálka) a 5 štrukturálne (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) proteínov. Každý z týchto proteínov sú syntetizované protilátky v krvi u pacientov s hepatitídou C,