Príčiny tuberkulózy

Skupina Mycobacteriaceae radu Actinomycetales obsahuje jediný rod Mycobacterium. V roku 1975 bol tento rod očíslovaný približne 30 druhmi a do roku 2000 bol tento počet takmer 100. Väčšina druhov mykobaktérií sa klasifikuje ako saprofytové mikroorganizmy, ktoré sa v životnom prostredí veľmi rozširujú.

Skupina povinných parazitov je nevýznamná, avšak jej praktický význam je veľký a je určený druhmi spôsobujúcimi tuberkulózu u ľudí a zvierat. Existuje názor, že predchodcovia ľudských patogénnych mykobaktérií boli staré mykobaktérie v pôde.

[1], [2], [3], [4],

Taxonomia mykobaktérií

Všetky mykobaktérie sú rozdelené na patogénne pre ľudí a podmienene patogénne.

V klinickej mikrobiológii sa na klasifikáciu mykobaktérií používa niekoľko prístupov:

• rýchlosťou a optimálnou teplotou rastu, schopnosťou tvoriť pigment;
• na klinicky významných komplexoch.

Druhy mykobaktérií spôsobujúce tuberkulózu sa kombinujú do komplexu M. Tuberculosis, vrátane M. Tuberculosis, M. Bovis. M. Bovis BCG, M. Africanum, M. Microti, M. Canettii. Nedávno bol mu pridelený M. Pinnipedii, M. Sargae, fylogeneticky príbuzný s M. Microti a M. Bovis.

Zvyšok mykobaktérií, ktoré spôsobujú rôzne mykobakterióza, je klasifikovaný ako netuberkulózne mykobaktérie. Z tejto skupiny sa rozlišujú nasledujúce komplexy: M. Avium, pozostávajúci z M. Avium, M. Intracellulare, M. Scrofulaceum; M.fortuitum vrátane poddruhov M.fortuitum a M. Chelonae a M. Terrae, vrátane M. Terrae, M. Triviale a M. Nonchromogenicum. Najdôležitejšími skupinami sú príčinné činidlá lepry z M. Leprae, ako aj príčinné faktory ulceróznych lézií Buruli M. Ulcerans.

Táto klasifikácia kombinuje typy mykobaktérií s rovnakým klinickým významom, keď ich jemnejšia diferenciácia je nevýznamná. Na identifikáciu druhov v rámci skupín a komplexov sa používajú biologické, biochemické a molekulárne metódy.

Klasifikácia netuberkulóznych mykobaktérií na základe kultúrnych rozdielov bola vyvinutá Runionom v roku 1959. Podľa nej. Sú izolované 4 skupiny mykobaktérií.

Skupina I - fotochromogénne mykobaktérie

Táto skupina zahŕňa mykobaktérie, ktoré nie sú pigmentované, keď rastú v tme, ale po vystavení svetlu získajú jasnú žltú alebo žltooranžovú pigmentáciu. Potenciálne patogénne kmene patriace do tejto skupiny. - M. Asiaticum, M. Kansasii, M. Marinum, M. Simiae. Medzi mykobaktériami tejto skupiny sú rýchlo rastúce (M. Marinum) a pomaly rastúce (M. Asiaticum, M. Kansasii). Optimálna teplota rastu v rozmedzí 25 ^až C M. Simiae, 32-33 ^o C počas M. Marinum 37 až ^asi C M. Asiaticum.

Najväčší klinický význam v našej krajine je forma M. Kansasii, ktorá sa nachádza vo vodných útvaroch. Kmeň M. Kansasii (M. Luciflavum) spôsobuje ochorenie u ľudí. Vajcia médium rastie ako hladkú kolónia 37 teplotné optimum ^z S. Morfologicky baktérií strednej dĺžky. K dnešnému dňu boli opísané dve varianty M. Kansasii: oranžová a biela. Po zavedení morčiat M. Kansasii spôsobuje infiltráty a zhutnenie regionálnych lymfatických uzlín.

Skupina II - scotochromogénne mykobaktérie (z gréckeho slova scotos - tma)

K tejto skupine patria mykobaktérie, ktoré tvoria pigment v tme. Rýchlosť rastu je 30-60 dní. Táto skupina zahŕňa M. Aquae (M. Gordonae) a M. Scrofulaceum.

M. Scrofulaceum sa týka potenciálne patogénnych druhov. Na vajcovom médiu rastú baktérie tohto druhu vo forme hladkých alebo drsných oranžových kolónií. Morfologicky sú mykobaktérie tyčové, krátke alebo dlhé. Rastú pri teplote 25-37 ^o C. Deti sú postihnuté lymfatickými uzlinami a pľúcami.

M. Aquae (M. Gordonae) sa označuje ako saprofytické scotochromogénne mykobaktérie. Na vajíčkovom médiu rastú ako oranžové kolónie pri teplote 25 - 37 ° C. Morfologicky je mykobaktéria tyčový a má strednú dĺžku (> 5 μm). Nájdené v nádržiach.

Skupina III - nefotochromogénne mykobaktérie

Táto skupina zahŕňa mykobaktérie, ktoré netvoria pigment alebo majú svetložltú farbu, ktorá nie je zosilnená svetlom. Rastú 2-3 alebo 5 až 6 týždňov. Niesť ich. M. Avium, M. Intracellulare, M. Xenopi, M. Terrae, M. Gastri, M. Hattey, M. Bruiiense.

M. Avium (Mycobacterium influenzae) rastú na Lowenstein-Jensen médium ako pigmentovaných alebo slabopigmentirovannyh kolónií pri 37 ^až C 45 a ^z S. Morfologicky - tyč s priemernou dĺžkou. Môžu byť patogénne pre ľudí a niekoľko laboratórnych zvierat, rovnako ako domáce zvieratá (napr. Ošípané). Nájdené vo vode a pôde.

M. Xenopi je oddelený od ropuchy. Mladé kultúry rastú vo forme nepigmentovaných kolónií. Neskôr sa objaví žltý pigment. Morfologicky dlhé závitové tyčinky. Rastú pri teplote 40-45 ^o C. Podmienečne patogénne pre ľudí.

M. Terra bol najskôr izolovaný z reďkovky. Rastú na médiu Levenstein-Jensen a forma bezfarebných kolónií. Optimálny rast je 37 ^° C. Morfologicky sú reprezentované stredne dlhými tyčinkami, saprofytmi.

Skupina IV - rýchlo rastúce mykobaktérie

Mykobaktérie patriace do tejto skupiny sú charakterizované rýchlym rastom (až 7-10 dní). Rastú vo forme pigmentových alebo pigmentových kolónií, často vo forme R-formy. Dobrý rast povolené 2-5 dní pri 25 ° C ^na C. Táto skupina zahŕňa potenciálne patogénnych mykobaktérií M.fortuitum a saprofytické mykobaktériami ako sú napríklad M. Phlei, M. Smegmatis, a ďalšie. M. Fortuitum poskytuje viditeľný rast na vajcovom médiu 2. - 4. Deň vo forme "rozetky". Morfologicky sú mykobaktérie reprezentované krátkymi tyčami. Na médiu Lowenstein-Jensen môžu pohltiť malachitové zelene a mať zelenú farbu. Rozsiahle v prírode.

Klasifikácia Runyon sa ukázala ako veľmi vhodná na identifikáciu najbežnejších druhov mykobaktérií. Avšak identifikácia nových druhov a výskyt čoraz väčšieho počtu medziproduktov mykobaktérií spôsobuje ťažkosti pri ich registrácii v určitej skupine Runyon.

M. Tuberculosis je mladá evolučná formačka. V súčasnosti existuje tendencia rozdeliť M. Tuberculosis na zhluky alebo rodiny. Najdôležitejšie sú kmene patriace do pekinskej rodiny, ktoré sa vyznačujú klonálnym správaním a schopnosťou spôsobiť mikrotubuly tuberkulózy.

Morfológia mykobaktérií

Mykobaktérie - tenké tyčinkové bunky s charakteristickou vlastnosťou odolnosťou voči kyselinám a alkoholom (v jednom zo štádií rastu), aeróbne. Gramové farbenie je slabo gram-pozitívne. Mykobaktérie sú nepohyblivé, netvoria spór. Nepoužívajú sa konídiá ani kapsuly. Rastú na hustom živnom médiu pomaly alebo veľmi pomaly: pri optimálnej teplote viditeľné viditeľné kolónie po 2-60 dňoch. Kolónie sú ružové, oranžové alebo žlté, najmä pri raste na svetle. Pigment sa nerozpúšťa. Povrch kolónií je zvyčajne matný (typ S) alebo drsný (typ R). Často mykobaktérie rastú vo forme slizníc alebo vrások kolónií. Na kvapalných médiách rastú mykobaktérie na povrchu. Jemná suchá fólia sa v priebehu času zahusťuje, stáva sa nerovnomerne zvrásnená a získava žltastý odtieň. Bujón zostáva priehľadný a je možné dosiahnuť difúzny rast v prítomnosti detergentov. V mikrokolónoch M. Tuberculosis (tj v počiatočných štádiách) sa vytvárajú štruktúry pripomínajúce zväzky - znak, ktorý je spojený s kordovým faktorom.

Pri farbení karbolickým fuchsínom sa mykobaktérium tuberkulóza odhaľuje ako tenké, mierne zakrivené tyčinky červenej farby s rôznym počtom granúl.

Dĺžka mykobaktérií je približne 1-10 μm. A šírka je 0,2-0,7 μm. Niekedy je možné nájsť zakrivené alebo komplikované varianty. Mikroorganizmy umiestnené jednotlivo, v pároch alebo v skupinách, dobre vystupujú proti modrému pozadiu ostatných zložiek prípravku. Často môžu byť bakteriálne bunky usporiadané vo forme rímskej číslice "V".

Pri príprave je taktiež možné odhaliť pozmenené formy kaučukovitých činidiel odolných voči kokotiám, zaoblené sférické alebo myceliálne podobné štruktúry. V tomto prípade musí byť kladná odpoveď potvrdená ďalšími metódami.

Štruktúra bunkovej steny mykobaktérií

Bunková stena mykobaktérií je najkomplexnejšia v porovnaní so zvyškom prokaryot.

Zatiaľ čo gramnegatívne baktérie majú dve membrány, bunková stena mykobaktérií pozostáva z niekoľkých vrstiev, z ktorých niektoré obsahujú cukry a sú charakterizované relatívne konštantnou kompozíciou. Vonkajšie vrstvy majú variabilné chemické zloženie a sú predovšetkým reprezentované lipidmi, z ktorých väčšina je kyselina mykolová a jej deriváty. Spravidla tieto vrstvy nie sú viditeľné v elektrónovej mikroskopii. Primárnym rámcom bunkovej steny sú zosieťované peptidoglykány - elektrón-hustá vrstva. Vrstva arabinogalaktánov opakuje vrstvu peptidoglykánov, čím tvorí polysacharidovú stromu bunkovej steny. Má body spojenia s peptidoglykánovou vrstvou a štruktúrami na fixáciu kyseliny mykolovej a jej derivátov.

Kyseliny mykolovej sú prítomné vo forme voľných sulfolipidov a kordových faktorov, ktorých prítomnosť na povrchu buniek je spojená s charakteristickou tvorbou M kolónií. Tuberkulóza vo forme popruhov. Jedinečnosť a kľúčová úloha kyseliny mykolovej v štruktúrnej organizácii a fyziológii mykobaktérií z nich robia výborný cieľ pre etiotropickú liečbu.

Vrstva glykolipidov sa nazýva "mykozidy" a niekedy sa porovnáva s mikrokapsulou. Mikozidy štruktúrne a funkčne podobné vonkajšej membrány lipopolysacharid z gram-negatívnych baktérií, ale ich nedostatkom agresivity, napriek tomu, že sú toxické a (faktor kábel podobný a sulfolipids) spôsobujú tvorbu granulómov.

Bunková membrána a vrstvy bunkovej steny sú prestúpené kanály alebo póry, z ktorých póry, ktoré majú pasívne krátku životnosť, poskytuje riadený difúziou látky, a kanály s dlhšou životnosťou, poskytovanie prepravných prchavé látky.

Ďalšou zložkou bunkovej steny mykobaktérií je lipoarabinomanan. Je zakotvená na plazmovej membráne, preniká bunkovou stenou a vystupuje na jej povrchu. V tomto ohľade je podobný lipoteichoovej kyseline gram-pozitívnych baktérií alebo lipopolysacharidového O-antigénu gramnegatívnych baktérií. Koncové fragmenty lipoarabinomannan, predovšetkým manosy radikály nešpecificky potláčať aktiváciu T-lymfocytov a leukocytov z periférnej krvi. To vedie k porušeniu imunitnej odpovede na mykobaktérie.

Variabilita a formy mykobaktérií

Pretrvávanie baktérií má osobitný patogenetický význam. Laboratórne pokusy uskutočnené in vitro a in vivo ukázali, že bakteriálne prípravky izoniazidu a pyrazínamidu zabíjajú mykobaktérie iba počas fázy rozmnožovania. Ak mykobaktérie sú vo fáze s nízkou metabolickú aktivitu (tj. Bakteriálna rast "spiace" možno nazvať takmer úplne zastavil a baktérie), baktericídne látky pôsobia na ne. Tento stav sa zvyčajne nazýva spiace a mikroorganizmy sa nazývajú pretrvávajú. Persisti nie sú citliví na chemoterapiu, t.j. Správať sa ako rezistentné mikroorganizmy. V skutočnosti môžu zostať citliví na drogy.

Silným podnetom na prechod mykobakteriálnych buniek do spánkového stavu sú chemoterapeutické činidlá, ako aj faktory hostiteľského imunitného systému. Persisti môžu prežiť v léziách mesiace alebo dokonca roky. Počas perzistencie sa mykobaktérie môžu transformovať do L-foriem. V tejto forme vykazujú mykobaktérie extrémne nízku metabolickú aktivitu, primárne zameranú na zvýšenie hrúbky bunkovej steny a extracelulárnej matrice, ktorá zabraňuje jednoduchému difúziu látok. Okrem toho v mykobaktériách dochádza k akumulácii genetického materiálu, čo umožňuje zvýšiť pravdepodobnosť rekonštrukcie normálne fungujúcej bunky za výhodných podmienok. Detekcia L-foriem štandardnými mikrobiologickými metódami je zložitá.

Ak spiace mykobaktérie znovu získajú metabolickú aktivitu a začnú sa množiť počas chemoterapie, rýchlo zomrú. Ak sa dokončí chemoterapia, také "oživené" mykobaktérie sa naďalej množia a spôsobia recidívu choroby. To vysvetľuje platnosť dlhých cyklov chemoterapie a aplikáciu následnej krátkej profylaktickej liečby. Ako pravidlo sezónneho priebehu chemoprofylaxie.

Fyziológia mykobaktérií

V oblasti prokaryotov sú mykobaktérie nepochybne lídrami v syntéze najkomplexnejších organických zlúčenín. Pravdepodobne majú najflexibilnejší metabolizmus a poskytujú potrebnú variabilitu pre prežitie vo vonkajšom prostredí av makroorganizme. Doteraz bolo opísaných viac ako 100 enzymatických reakcií, ktoré ukazujú rozvetvený a komplexný charakter metabolizmu mykobaktérií. Pre syntézu konečných zlúčenín alebo pre zabezpečenie potrebných fyziologických funkcií v mykobaktérií môže byť vykonaná paralelné dráhy, v závislosti od dostupnosti substrátu, chemickom prostredie, bezpečnosť respiračných cyklov potrebných zložiek (kovových iónov, parciálny tlak kyslíka, oxidu uhličitého a ďalšie.).

Biochemické vlastnosti mykobaktérií

[5], [6], [7], [8], [9], [10]

Metabolizmus lipidov

Lipidy bunkovej steny, ktoré tvoria až 60% suchej hmotnosti bunky, určujú nestandardnú povahu tinktoriálnych, fyziologických a ekologických vlastností mykobaktérií.

Doteraz popísané špecifické lipidy mykobaktérií sú štrukturálne rozdelené do 7 hlavných skupín:

1. deriváty karbohydrátov mastných kyselín (hlavne trehalóza - šnúra):
2. manozidy fosfatidylmiozínu:
3. deriváty mastných kyselín peptidov;
4. glykozidy N-acylpeptidov - mykozidy C;
5. estery mastných kyselín s fluórtyroly;
6. mykozidy A, B. G;
7. Mykoly glycerínu.

Lipidy zo skupín 4 až 6 sa vyskytujú iba v mykobaktériách.

Medzi unikátne je potrebné poznamenať, že tuberkulostearické a tuberkulopalmitové kyseliny, ktoré sú prekurzormi kyseliny mykolovej.

Mikolovská kyselina - skupina vysokomolekulárnych mastných kyselín s dĺžkou reťazca až 84 uhlíkových atómov, štruktúra hlavného reťazca je určená systematickou polohou mikroorganizmu a podmienkami jeho rastu. Ich nízka reaktivita poskytuje vysokú chemickú stabilitu bunkovej steny mykobaktérií. Mikolata potláčajú enzymatické štiepenie bunkovej steny a reakcií s voľnými radikálmi.

Faktor šnúry sa pripisuje prvej skupine lipidov. Je spojená s vysokou toxicitou mykobaktérií a virulencie.

Povrchovo aktívne lipidy alebo sulfolipidy hrajú dôležitú úlohu pri intracelulárnej adaptácii mykobaktérií. Spolu s faktorom šnúry vytvárajú cytotoxické membránové -tropické komplexy.

Lipoarabinomannan je heterogénna zmes vysokej molekulovej lipopolysacharid: rozvetvených polymérov s Arabinóza a manóza derivátov diatsilglitserinovymi tuberkulostearinovoy a kyseliny palmitovej.

Mykozidy C sú peptidoglykolipidy. Tvoriac vonkajší plášť mykobaktérií, ktorý je možné pozorovať pomocou elektrónovej mikroskopie vo forme priehľadnej zóny na obvode buniek. Mykozidy sú druhovo špecifické zlúčeniny. Antigénne vlastnosti mykobaktérií závisia od ich typu.

Kvantitatívne a kvalitatívne zloženie lipidových zlúčenín mykobaktérií je dynamické a závisí od veku buniek, zloženia živného média a fyzikálno-chemických vlastností prostredia. Mladé bunky mykobaktérií začínajú tvoriť bunkovú stenu zo syntézy lipopolysacharidov s relatívne krátkymi alifatickými reťazcami. V tejto fáze sú celkom zraniteľné a prístupné imunitnému systému. S rastom bunkovej steny a tvorbou vysokomolekulárnych lipidov získavajú mykobaktérie stabilitu a lásku vo vzťahu k imunitnému systému.

Metabolizmus sacharidov

Najvýhodnejším zdrojom uhlíka pre mykobaktérie je glycerol.

Najdôležitejšími sacharidmi sú arabinóza. Manózu a maltózu - predstavujú viac ako polovicu všetkých sacharidov. Navyše v živote buniek hrajú úlohu trehalóza, glukóza, fruktóza, galaktóza, ramnóza a niektoré ďalšie sacharidy. Súčasne sa táto syntéza uskutočňuje pozdĺž ciest hydrolázy a aldolázy. Pyruvátová dráha sa používa na syntézu glykogénu. Arabínóza a manóza sa podieľajú na tvorbe dôležitých štruktúrnych zlúčenín. Na získanie energie sa používa pentóza fosfátová dráha oxidácie glukózy. Poskytuje sa malát, izokitrát a sukcinátdehydrogenázy, čo dýchaciemu systému umožňuje flexibilitu.

Glyoxylátová dráha je jedinečná, pričom mykobaktérie sa používajú na zahrnutie voľných mastných kyselín do cyklu kyseliny trikarboxylovej, ktoré sa hromadia počas rastu mykobaktérií. Tento cyklus priťahuje pozornosť výskumníkov ako možný mechanizmus chemotaxie mykobaktérií počas perzistencie.

Metabolizmus dusíka a aminokyselín

Rýchlosť využitia dusičnanov mykobaktérií, dusitanov, hydroxylamínov môže slúžiť na identifikáciu druhov. Ako zdroj dusíka preferujú mykobaktérie asparagín. Syntéza aminokyselín je prchavý proces a poskytuje skupina enzýmov, ktoré umožňujú použitie iných aminokyselinových zlúčenín, napríklad glutamátu.

Účinnosť nitritu a nitrátovej reduktázy

Mycobacterium tuberculosis môžu tvoriť adenozíntrifosfátu (ATP) v prevode prenos reťazca elektrónov zastavenie NO ₃ -, ale nie O ₂ Pri tejto reakcii dochádza k rekonštitúciu NO ₃ NH _3, v množstvách, ktoré sú potrebné pre syntézu aminokyselín, purínových a pyrimidínových báz. Toto sa vykonáva postupným pôsobením nitrátových a dusitanových reduktáz.

Katalázová a peroxidázová aktivita

Kataláza zabraňuje hromadeniu peroxidu vodíka, ktorý vzniká počas aeróbnej oxidácie rekonštituovaných flavoproteínov. Enzýmová aktivita závisí od pH média a teploty. Pri teplote 56 ° C nie je kataláza aktívna. Existujú testy patriace k patogénnemu komplexu mykobaktérií na základe tepelnej stability katalázy.

Je známe, že 70% kmeňov Mycobacterium tuberculosis, rezistentných na izoniazid, stráca svoju katalázovú a peroxidázovú aktivitu.

Peroxidázová a katalázová aktivita sa uskutočňuje rovnakým enzýmovým komplexom.

[11], [12], [13], [14], [15]

Vitamíny a koenzýmy

Štruktúra M. Tuberculosis zahŕňajú vitamíny B (riboflavín, pyridoxín. Cyanocobalamin tiamín), vitamín C a K. Kyselina p-aminobenzoová a pantoténovú kyselinu nikotínovú, biotín a kyselinu listovú.

Metabolizmus, výživa a dýchanie mykobaktérií

Za obvyklých a priaznivých podmienok mycobacterium tuberculosis - prísne aeróby a mezofily, t.j. Rastú v prítomnosti kyslíka a v teplotnom rozmedzí 30-42 ^o C, s výhodou pri 37 ° C ^za S. Za nepriaznivých podmienok okolitého prostredia, a (alebo) kyslíka nedostatok Mycobacterium tuberculosis prejavujú ako Microaerophiles a dokonca aj anaeróbnych baktérií. Súčasne dochádza k významným zmenám ich metabolizmu.

Pri konzumácii kyslíka a vývoji oxidázových systémov sú mykobaktérie podobné skutočným hubám. Ako spojenie medzi NADH-dehydrogenázy a cytochrómu b v odovzdávacom systéme rodu Mycobacterium je vitamín K ₉. Tento systém cytochrómov sa podobá na mitochondriálny systém. Je citlivý na dinitrofenol, ako aj na vyššie organizmy.

Typ opísaného dýchania nie je jediným zdrojom tvorby ATP. Ďalej O ₂ terminálne. Mykobaktérie môžu používať respiračné reťazce, ktoré prenášajú elektróny a ukončujú sa v dusičnane (NO ₃ ^- ). Rezervou respiračného systému mykobaktérií je glyoxylový cyklus.

Anoxické (endogénne) dýchanie, ktoré sa prejavuje v atmosfére s koncentráciou kyslíka menej ako 1%, stimuluje azidové zlúčeniny, ktoré znižujú oxidáciu pyruvátu alebo trehalózy.

Rast a reprodukcia mykobaktérií

Mycobacterium tuberculosis sa chová extrémne pomaly: doba zdvojenia je 18-24 hodín (bežné baktérie sa delia každých 15 minút). Preto na dosiahnutie viditeľného rastu typických kolónií trvá najmenej 4-6 týždňov. Jedným z dôvodov pomalého rozmnožovania mykobaktérií je ich výrazná hydrofóbnosť, čo sťažuje difúziu živín. Je pravdepodobnejšie, že je to geneticky determinované a je spojené so zložitejším zariadením mykobaktérií. Je známe napríklad, že väčšina baktérií má viac kópií operónu ribonukleovej ribonukleovej kyseliny (rRNA). Pomaly rastúce mykobaktérie (M. Tuberculosis, M. Leprae) majú jednu kópiu operónu a rýchlo rastúci (M. Smegmatis) majú iba dve kópie.

Keď sa kultivujú na kvapalnom médiu, mykobaktérie rastú na povrchu. Jemná suchá fólia sa nakoniec zahusťuje a stáva sa nerovnomerne vrásčitá a získava žltastý nádych, často v porovnaní s farbou slonoviny. Bujón zostáva priehľadný a je možné dosiahnuť difúzny rast iba v prítomnosti detergentov, napríklad Tween-80. V mikrokolónoch (tj v počiatočných štádiách) sa vytvárajú štruktúry pripomínajúce zväzky, znak, ktorý je spojený s kordovým faktorom M. Tuberculosis.

Genetika mykobaktérií

Rod mykobaktérií je z genetického hľadiska veľmi rôznorodý. Na rozdiel od mnohých saprofytických a netuberkulóznych mykobaktérií mycobacterium tuberculosis neobsahuje extrachromozomálne inklúzie (napríklad plazmidy). Celá škála vlastností mycobacterium tuberculosis je určená jeho chromozómom.

Genóm komplexu M. Tuberculosis je mimoriadne konzervatívny. Jej predstavitelia majú DNA homológiu na úrovni 85-100%. Zatiaľ čo DNA iných mykobakteriálnych druhov je homologická s M. Tuberculosis len 4-26%.

Zástupcovia rodu Mycobacterium majú veľké genómy v porovnaní s inými prokaryotmi - 3,1-4,5x10 ⁹ Da. Avšak genómy patogénnych druhov sú menšie ako u iných mykobaktérií (v M. Tuberculosis - 2,5 x ¹⁰⁹ Da). Klasický pôvodca ľudskej tuberkulózy, M. Tuberculosis, má viac génov ako M. Africanum a M. Bovis, ktoré pri vývoji stratili časť genetického materiálu.

V roku 1998 bola publikovaná nukleotidová sekvencia chromozómu kmeňa H37Rv M. Tuberculosis. Jeho dĺžka je 4 411529 párov báz. Chromozóm Mycobacterium tuberculosis je kruhová štruktúra. Obsahuje asi 4000 génov kódujúcich proteíny, rovnako ako 60. Kódujúce funkčné zložky RNA: jedinečný ribozomálny RNA operón, 10Sa RNA. Zapojených do degradácie proteínov s atypickou matricovou RNA. 45 transportnej RNA (tRNA), viac ako 90 lipoproteínov.

Viac ako 20% genómu je obsadená génmi bunkovej steny metabolizmus mastných kyselín, vrátane mykolových kyselín, bohaté na glycín kyslom polypeptidu (rodina PE a PPE) kódovaný polymorfných PGRS genomových častí (polymorfná GC-bohaté opakujúce sa sekvencie) a MPTR (hlavný polymorfné tandemových opakovaní) (piaty a štvrtý krúžok genómovej chromozómovej mapy). Variabilita týchto častí genómu poskytuje rozdiely v antigénoch a schopnosť inhibovať imunitnú odpoveď. Gény kontrolujúce faktory virulencie sú široko zastúpené v genóme mycobacterium tuberculosis.

Mycobacterium tuberculosis syntetizuje všetky zložky nevyhnutné pre metabolizmus: esenciálne aminokyseliny, vitamíny, enzýmy a kofaktory. V porovnaní s inými bakteriálnymi druhmi sa aktivita enzýmov lipogenézy u M. Tuberculosis zvýšila. Dva gény kódujú proteíny podobné hemoglobínu, ktoré zohrávajú úlohu antioxidačných ochrancov alebo pasce nadbytku bunkového kyslíka. Tieto znaky prispievajú k rýchlej adaptácii mykobaktérie tuberkulózy na náhle zmeny v podmienkach prostredia.

Zvláštnosťou genómu komplexu M. Tuberculosis je veľké množstvo opakujúcich sa sekvencií DNA. So. M. Tuberculosis H37Rv chromozómu počítať až 56 kópií IS-prvky (vloženie sekvencií - sekvencie vloženej DNA), ktoré poskytujú polymorfizmus Mycobacterium tuberculosis. Väčšina z nich. Okrem prvku IS6110. Sú nezmenené. Zloženie chromozómov rôznych kmeňov Mycobacterium tuberculosis, je obvykle prítomný v množstve od 5 do 20 kópií IS6110 však vyskytujú kmene, ktoré nemajú tento prvok. Spolu s IS-prvkami gen obsahuje niekoľko typov krátkych nukleotidových repetíciami (PGRS a MPTR), rovnako ako priame repetície DR (Priamy opakovanie), ktorý sa nachádza v DR-poľa a samostatných variabilných sekvencií - dištančné prvky (šiesty krúžok na mape chromozómu). Rozdiely v počte kópií a lokalizácia chromozómov týchto genetických prvkov sa používajú na diferenciáciu kmeňov mycobacterium tuberculosis v molekulárnej epidemiológii. Najpokročilejšie schémy genotypizácia založené na identifikácii mykobaktérií genomické polymorfizmus spôsobené IS6110 prvok, rovnako ako DR a rozperky. Je charakteristické, že divergencia M. Tuberculosis sa spravidla vyskytuje v dôsledku rekombinácií medzi kópiami prvku IS6110. Ktoré lemujú rôzne gény.

V genóme H37Rv sa našli dve prophages - phiRv1 a phiRv2. Rovnako ako polymorfická lokalita Dral sú. Pravdepodobne súvisiace s patogenitou faktorov, pretože tieto časti genómu sú odlišné z analogických miest avirulentní kmene M. Tuberculosis H37Ra a M. BOM BCG, vymedzených častiach genómu (Mutt, OGT-gény), ktorý je zodpovedný za zvýšenie frekvencie mutácie a adaptácia Mycobacterium tuberculosis v pressovyh podmienky. Detekcia spúšť gén Mycobacterium tuberculosis dormantnosti zmenil myšlienku latentnej TB infekcie.

Štúdium polymorfizmu génov kódujúcich katalázu, peroxidázu a A-podjednotku DNA-gyrázy. V komplexe M. Tuberculosis boli izolované tri genotypové skupiny. Najstaršia (z hľadiska vývoja) skupina I: M. Africanum, M. Bovis. M. Tuberculosis a M. Microti. Skupina II a III zahŕňajú rôzne kmene M. Tuberculosis, ktoré sa rozšírili v niektorých zemepisných oblastiach. Clonové správanie je charakteristické pre skupiny I a II a kmene III. Skupiny veľmi zriedka spôsobujú masové choroby. V rôznych oblastiach sveta sú bežné genetické rodiny M. Tuberculosis, ktoré dostali názvy Haarlem. Afrika, Filipínska.

Zvláštne miesto je obsadené rodinou Peking, najprv identifikovaná v histologických prípravách pľúcneho tkaniva v rokoch 1956-1990. Od chorých na predmestí v Pekingu. Pre dnešné kmene tejto rodiny sa nachádzajú v ázijských štátoch. Južná Afrika, Karibik, Spojené štáty. Rozdelenie tohto genotypu na rôzne územia je podmienené etnickými charakteristikami domorodého obyvateľstva a migrantov. Nedávno boli získané údaje o rozdelení kmenov genotypu SI / Peking v severozápadnej európskej časti Ruska (Petrohrad) av oblastiach Sibíri.

Stabilita mykobaktérií

Počas vývoja mycobacterium tuberculosis sa vyvinuli rôzne mechanizmy na prekonanie alebo deaktiváciu nepriaznivých faktorov životného prostredia. V prvom rade. To je silná bunková stena. Po druhé, existujú rozsiahle možnosti metabolizmu. Sú schopní inaktivovať mnohé bunkové toxíny a látky (rôzne peroxidy, aldehydy a ďalšie látky), ktoré ničia bunkovú membránu. Po tretie, ide o morfologickú plasticitu, ktorá spočíva v transformácii mykobaktérií (tvorba L-foriem spánkovými bunkami). Svojou stabilitou po baktériách vytvárajúcich spóry zaujímajú vedúce miesto v oblasti prokaryotov.

Príčinná látka si zachová svoju životnosť v suchom stave až 3 roky. Keď sa ohrieva Mycobacterium tuberculosis, môže vydržať teploty nad 80 ° C. K dnešnému dňu sa predpokladá, že baktérie mycobacterium tuberculosis, ktoré sú v hlienu, zostávajú životaschopné, keď sa tento varí do 5 minút.

Mycobacterium tuberculosis rezistentné na organických a anorganických kyselín, zásad, mnohých oxidačných činidiel, a tiež k rade antiseptických a dehydratačných látky, ktoré majú škodlivý vplyv na iných patogénnych mikroorganizmov. Mykobaktérie sú odolné voči alkoholom a acetónu.

Je potrebné poznamenať, že činidlá na báze kvartérneho amónia nevykazujú anti-tuberkulóznu aktivitu, za určitých podmienok nemajú koncentrácie chlórových a kyslíkových radikálov až do 0,5% škodlivý účinok na mykobaktériu tuberkulózy. To znamená, že nemožno použiť také prostriedky na sterilizáciu spúta a iných infikovaných biologických materiálov.

Mycobacterium tuberculosis je necitlivý na difúzne slnečné svetlo a môže existovať dlhšie ako jeden rok vo vonkajšom prostredí bez straty životaschopnosti. Krátkotlaková ultrafialová štúdia má univerzálny baktericídny účinok na všetky mikroorganizmy. Avšak v reálnych podmienkach, keď je mykobaktérium tuberkulóza suspendovaná vo forme bunkových aglomerátov s časticami prachu, sa zvyšuje ich odolnosť voči ultrafialovému žiareniu.

Vysoká miera prežitia Mycobacterium tuberculosis prispieva k extrémne širokému šíreniu tejto infekcie u populácie bez ohľadu na klimatické podmienky. To však nielen prispieva k globalizácii problému - mycobacterium tuberculosis môže pretrvávať dlhý čas v ľudskom tele a môže sa znovu aktivovať v neobmedzených intervaloch.

Lokalizácia Mycobacterium tuberculosis vnútri makrofágov zaistiť dostatočnú stabilitu substrátu, s ohľadom na "dlhovekosti" mononukleárny fagocyty a trvanie replikáciu mykobaktérií, ako aj izoláciu efektory humorálnej imunity. Súčasne patogén vyberá biotop, ktorý je kvôli potenciálnemu nebezpečiu neprijateľný pre väčšinu mikroorganizmov. Táto symbióza je zabezpečená množstvom adaptačných mechanizmov mykobaktérií.

Proces poškodenia makrofágov a parazitizmu v ňom vyzerá takto: penetrácia mykobaktérií do makrofágu bez jeho aktivácie; potlačenie tvorby alebo transformácie fagolysozómov do zóny, ktorá je vhodná pre baktérie; prenikanie z fagozómov do cytoplazmy s inaktiváciou antimikrobiálnych faktorov; interferencia v živote bunky; oslabenie citlivosti makrofágov na aktivačné signály T-lymfocytov; zníženie funkcie prezentujúcej antigén makrofágov a následné oslabenie reakcií cytotoxických T-lymfocytov naladených na deštrukciu infikovaných buniek.

Nepochybne pri poskytovaní tejto dôležitej úlohy zohrávajú vlastnosti bunkovej steny. Ako aj metabolických a funkčných schopností. Pri prvom kontakte s mikroorganizmom Mycobacterium imunitný systém nie je schopný sa pripojiť humorálnu imunitu rýchlo neutralizáciu a odstránenie bunky z tela, pretože pohyblivý alifatický reťazec obsahujúci mykobakteriálne steny neumožňujú vyhodnotenie povrchové štruktúry patogénu a odovzdávať príslušné informácie potrebné pre syntézu sady protilátok.

Vysoká hydrofóbnosť mykobaktérií poskytuje nešpecifické, t.j. Nezávisle od receptorov, kontaktov s makrofágmi. Tvorí okolo mykobaktériového bunkového fagozómu, makrofág je umiestni do seba. Povrchové mykozidické komplexy a lipoarabinomananové komplexy môžu byť rozpoznané receptormi, avšak signály, ktoré sa cez ne aktivujú, neaktivujú alebo slabo aktivujú makrofágy. V dôsledku toho fagocytóza nie je sprevádzaná uvoľňovaním voľných radikálových foriem kyslíka a dusíka. Predpokladá sa, že je to typickejšie pre virulentné kmene M. Tuberculosis, ktoré vzhľadom na štruktúrne znaky lipoarabinomananu iniciujú "neagresívnu" fagocytózu. Pri rozpoznávaní M. Tuberculosis sa tiež zúčastňujú ďalšie makrofágové receptory, najmä CD 14 a receptory komplementovej zložky C3 (CR1-CR3).

Akonáhle je vo vnútri makrofágov, Mycobacterium zahŕňa rad mechanizmov, ktoré zabraňujú phagolysosome formácie: výroba amoniaku, ktorý bol zalkalizuje prostredie v fagosomem sulfolipids syntézy, čo vedie k vytvoreniu negatívneho náboja na povrchu fagozomu. čo zabraňuje fúzii fagozómu a lyzozómu.

Ak však phagolysosome je vytvorený, vzhľadom k silnej mycobacterium vosku plášťa schopné uhasiť voľné radikáli reakcie spôsobené fagocytov baktericídne látky. Amónium alkalizuje médium, blokuje aktivitu lyzozomálnych enzýmov a sulfolipidy neutralizujú membránovo-katiónové proteíny. Okrem toho, Mycobacterium tuberculosis produkovať vysoko aktívne enzýmy s katalázy a aktivity peroxidázy, ktoré súťažia s peroxidáze systémami makrofágy a súčasne inaktiváciu hydroperoxidy lysozomy To všetko zvyšuje odolnosť mykobaktérií do oxidačného činidla stres.

Ďalšia adaptácia mykobaktérií spočíva v použití makrofágov obsahujúcich železo pre ich enzýmové systémy a blokovanie imunospecifických funkcií makrofágov. Makrofágy sú jedným z hlavných zásobníkov železa, ktorých prebytok sa hromadí vo forme feritínu. Obsah železa v alveolárnych makrofágoch je 100-krát vyšší ako v krvných monocytoch, čo určite prispieva k ich kolonizácii tuberkulózou mykobaktérií.

Toxický účinok mykobaktérií na makrofágy sa uskutočňuje prostredníctvom endotoxínov a nešpecifických faktorov. Obaja aj iní postihujú primárne dýchaciu sústavu makrofágov - mitochondrií. Medzi endotoxíny patria mykolické arabinolipidy, ktoré inhibujú dýchanie mitochondrií. K nešpecifickým toxínom patria produkty syntézy lipidovej časti mykobaktériovej bunky - ftiénu a kyseliny ftalovej, ktoré spôsobujú disociáciu oxidatívnej fosforylácie. Zintenzívnenie metabolických procesov za týchto podmienok nie je sprevádzané správnou syntézou ATP. Hostiteľské bunky začínajú požívať energetický hlad, čo vedie k inhibícii ich vitálnej aktivity a v budúcnosti k cytolýze a apoptóze.

Je možné, že niektoré faktory patogénnosti sa vytvárajú iba vo vnútri infikovaných buniek, čo sa deje v iných baktériách, ktoré uprednostňujú intracelulárny životný štýl. Napríklad salmonely, parazitujúce vo vnútri makrofágov, navyše vyjadrujú viac ako 30 génov. Napriek úplnému opisu genómu mycobacterium tuberculosis. 30% kodónov súvisí s proteínmi s neznámymi vlastnosťami.

Liečivá rezistencia mykobaktérií

Z klinického hľadiska citlivosť mikroorganizmu na liečivo určuje možnosť použitia štandardnej chemoterapie s indikovaným liečivom na liečenie ochorenia spôsobeného izolovaným kmeňom. Stabilita "predpovedá zlyhanie liečby testovaným chemoterapeutickým liekom." Inými slovami, použitie štandardnej chemoterapie vedúce k dosiahnutiu systémovej koncentrácie lieku, zvyčajne účinnej pri normálnych podmienkach, nepotláča reprodukciu "rezistentných mikroorganizmov".

V mikrobiológii je prístup obyvateľstva založený na definícii citlivosti na liek alebo rezistencii na liek, čo znamená iný stupeň stability skupiny (heterogénnej populácie) mikrobiálnych buniek. Rezistencia voči liekom sa posudzuje v kvantitatívnych charakteristikách, ako je "minimálna inhibičná koncentrácia" (MIC). Napríklad s MIK-90 zomrie 90% mikroorganizmov (bakteriostatická koncentrácia). Rezistencia sa preto musí chápať ako jej stupeň v časti mikrobiálnej populácie, ktorá predurčuje zlyhanie liečby vo väčšine prípadov. Všeobecne sa uznáva, že 10% rezistentných kmeňov z celej mikrobiálnej populácie pacienta môže mať patogénny účinok. Vo ftiziobaktériológii pre lieky proti rakovine prvej línie je to 1%. Alebo 20 jednotiek tvoriacich kolónie - CFU). Táto časť mikrobiálnej populácie za mesiac dokáže vytlačiť originál a vytvoriť zameranie lézie. Pre anti-TB liečivá druhého radu je kritériom stability 10% nárast mikrobiálnej populácie.

Vývoj rezistencie mikroorganizmov na liečivá je spojený s selekciou (výberom) v prítomnosti antibiotika as prevládajúcim prežívaním časti mikrobiálnej populácie, ktorá má ochranné mechanizmy proti antibakteriálnemu činidlu. Každá populácia je malý počet mutantných buniek (zvyčajne 10 ⁶ -10 ⁹ ), odolný proti konkrétnej liečivo. Počas chemoterapie citlivé mikrobiálne bunky umierajú a rezistentné sa množia. V dôsledku toho sú senzorické bunky nahradené stabilnými bunkami.

Mykobaktérie majú na začiatku vysokú prirodzenú rezistenciu voči mnohým antibakteriálnym liekom so širokým spektrom účinku, ale rôzne druhy majú rozdielne spektrum a stupeň citlivosti.

Na základe skutočného prírodné konštanta stability pochopiť Špecifikom mikroorganizmy spojené s neprítomnosti cieľovej antibioticky alebo z dôvodu nedostupnosti primárnej cieľovej nízkej priepustnosti bunkovej steny, enzymatické inaktivácie látky alebo iných mechanizmov.

Získaná rezistencia je vlastnosťou jednotlivých kmeňov, aby zostali životaschopné pri tých koncentráciách antibiotík, ktoré inhibujú rast hlavnej časti mikrobiálnej populácie. Získanie rezistencie vo všetkých prípadoch je geneticky spôsobené: vznik nových genetických informácií alebo zmena úrovne vyjadrovania vlastných génov.

V súčasnej dobe boli objavené rôzne molekulárne mechanizmy rezistencie mykobaktérií tuberkulózy:

• inaktivácia antibiotík (inaktivácia fermentácie), napríklad ß-laktamazámov;
• modifikácia cieľa účinku (zmena priestorovej konfigurácie proteínu v dôsledku mutácie zodpovedajúcej oblasti genómu):
• hyperprodukciu cieľa, čo vedie k zmene pomeru cieľového činidla k uvoľňovaniu časti životne dôležitých proteínov baktérie;
• aktívne odstránenie liečiva z mikrobiálnej bunky (eflux) v dôsledku zahrnutia mechanizmov ochrany proti stresu:
• zmeniť parametre priepustnosti vonkajších mikrobiálnych bunkových štruktúr, ktoré blokujú schopnosť antibiotika preniknúť do vnútra bunky;
• Zahrnutie "metabolického posunu" (obtoková cesta).

Okrem priamej účinky na metabolizmus mikrobiálnych buniek, vrátane antibiotík (benzylpenicilín. Streptomycín, rifampicín) a ďalšie nežiaduce faktory (biocídy imunitného systému), vedie k vzniku modifikovaných foriem mykobaktérií (protoplastov, L-formy). Ako aj prenášať bunky do nečinného stavu: intenzita výmeny buniek klesá a baktéria sa stáva imunitou voči pôsobeniu antibiotika.

Všetky mechanizmy vytvárajú iný stupeň rezistencie, poskytujú odolnosť voči rôznym koncentráciám chemoterapeutických liekov, takže vznik rezistencie v baktériách nie je vždy sprevádzaný poklesom klinickej účinnosti antibiotika. Na posúdenie účinnosti a prognózy liečby je dôležité poznať stupeň rezistencie.

V súčasnosti sa pre každý antituberkulózny liek prvej série a pre väčšinu rezervných prípravkov určuje aspoň jeden gén. špecifické mutácie, ktoré vedú k vývoju rezistentných variantov mykobaktérií. Pri širokom rozšírení rezistencie na liečivo v mykobaktériách je dôležitejšia než in vitro vysoká incidencia mutácií in vivo.

[16], [17], [18], [19], [20], [21], [22], [23], [24], [25],

Druhy rezistencie mykobaktérií na liečivo

Rozlišujte medzi primárnou a získanou rezistenciou na liek. Medzi mikroorganizmy s primárnou rezistenciou patria kmene izolované od pacientov, ktorí nedostali špecifickú liečbu, alebo ktorí dostávali lieky po dobu jedného mesiaca alebo menej. Ak nie je možné objasniť skutočnosť, že sa používajú lieky proti tuberkulóze, používa sa pojem "počiatočný odpor".

Primárna rezistencia je veľký klinický a epidemiologický význam preto, aby jeho správne posúdenie by nemala vykonávať nových prípadov TBC chemoterapie mikrobiologické štúdie diagnostického materiálu. Frekvencia primárne liekovej rezistencie sa vypočíta ako podiel počtu novo diagnostikovaných pacientov s TBC s primárnou rezistencie voči počtu všetkých novo diagnostikovaných pacientov, ktorí dostávali hodnotený liek náchylnosť k cieľu Ak rezistentné kmeň izolovaný od pacienta v pozadí anti-TB terapia vykonávané po dobu jedného mesiaca alebo viac, stálosť ako získané. Frekvencia primárnej rezistencie lieku charakterizuje epidemiologický stav populácie patogénnych TBC.

Získaná rezistencia liekov medzi novodiagnostikovanými pacientmi je výsledkom neúspešnej liečby (nesprávny výber liekov, nedodržanie režimu, nižšie dávky liekov, nestabilné zásoby a nízka kvalita liekov). Tieto faktory vedú k zníženiu systémovej koncentrácie liekov v krvi a ich účinnosti, zatiaľ čo súčasne "spúšťajú" ochranné bunky v mykobakteriálnych bunkách.

Na epidemiologické účely sa vypočíta frekvencia predtým liečených prípadov. Na tento účel sa berú do úvahy pacienti, ktorí boli prijatí na opakovanú liečbu po neúspešnom priebehu chemoterapie alebo relapsov. Pomer počtu rezistentných kultúr mycobacterium tuberculosis sa vypočíta na základe počtu všetkých kmeňov vyšetrených na prítomnosť rezistencie na liek počas roka u pacientov tejto skupiny v čase ich registrácie.

V štruktúre rezistencie voči lieku sa rozlišuje tuberkulóza mykobaktérií:

Monorezistencia - odolnosť voči jednému z protituberkulóznych liečiv, zachováva sa citlivosť na iné lieky. Pri použití komplexnej terapie sa zriedka deteguje jednoznačná rezistencia. Spravidla na streptomycín (v 10-15% prípadov u novodiagnostikovaných pacientov).

Viacnásobná rezistencia voči liekom - odolnosť proti dvom alebo viacerým liekom.

Viacnásobná rezistencia voči lieku - odolnosť voči izoniazidu a rifampicínu súčasne (bez ohľadu na dostupnosť rezistencie voči iným liekom). Sú sprevádzané spravidla rezistenciou na streptomycín atď. V súčasnosti sa MDR patogénov tuberkulózy stalo epidemiologicky nebezpečným javom. Výpočty ukazujú, že detekcia patogénov s MDR vo viac ako 6,6% prípadov (medzi novodiagnostikovanými pacientmi) si vyžaduje zmenu stratégie Národného programu pre tuberkulózu. Podľa monitorovania rezistencie na liek je frekvencia MDR medzi novo diagnostikovanými pacientmi 4 až 15%, medzi relapsmi - 45-55% a medzi prípadmi neúspešnej liečby - až 80%.

Superstabilita - viacnásobná rezistencia liečiv kombinovaná s rezistenciou na fluórchinolóny a jedným z injekčných liekov (kanamycín, amikacín, kapreomycín). Tuberkulóza spôsobená kmeňmi so superstabilitou predstavuje priamu hrozbu pre život pacientov, pretože iné lieky proti tuberkulóze druhého radu nemajú výrazný antibakteriálny účinok. Od roku 2006 sa v niektorých krajinách monitoruje distribúcia kmeňov mykobaktérií so superstabilitou. V zahraničí je zvykom označiť túto verziu MDR ako XDR.

Krížová rezistencia - keď vznik rezistencie voči jednému lieku spôsobuje rezistenciu voči iným liekom. V prípade M. Tuberculosis sa mutácie spojené s rezistenciou spravidla netýkajú. Vývoj krížovej rezistencie je spôsobený podobnosťou chemickej štruktúry niektorých liekov proti tuberkulóze. Obzvlášť často sa zisťuje krížová rezistencia v rámci jednej skupiny liečiv, napríklad aminoglykozidov. Na predikciu krížovej rezistencie sú potrebné štúdie kultúry mykobaktérií na genetickej úrovni v kombinácii s mikrobiologickou štúdiou rezistencie.

netuberkulózne Mycobacterium

Nonsuberculózne mykobaktérie sa prenášajú z človeka na človeka veľmi zriedkavo. Frekvencia prideľovania niektorých druhov z materiálu od pacientov je porovnateľná s frekvenciou týchto druhov z objektov vonkajšieho prostredia. Zdrojem infekcie môžu byť hospodárske zvieratá a vtáky, nespracované potraviny. Mykobaktérie sa nachádzajú v postmortálnom materiáli av mlieku dobytka.

Podľa bakteriologických laboratórií prevalencia netuberkulóznych mykobaktérií v rokoch 2004-2005 bola 0,5 až 6,2% zo všetkých mykobaktérií u novodiagnostikovaných pacientov. Pravdepodobne môže byť frekvencia o niečo vyššia, pretože metóda používaná na spracovanie diagnostického materiálu nie je optimálna pre netuberkulózne mykobaktérie. Saprofytické mykobaktérie môžu byť prítomné v diagnostickom materiáli, ak nie sú dodržané pravidlá zberu alebo kvôli špecifite materiálu (napríklad M. Smegmatis sa môže vylúčiť z moču mužských pacientov).

Z tohto hľadiska je dôležité opakovane potvrdiť zistené druhy mykobaktérií z materiálu od pacienta.

Mykobaktérie postihujú kožu, mäkké tkanivo a môžu tiež spôsobiť mykobakteriózu pľúc, čo je obzvlášť časté v imunodeficientných podmienkach. Pľúcna lokalizácia je častejšie detekovaná u starších mužov, ktorých história zahŕňa chronické pľúcne ochorenia, vrátane tých s hubovými léziami.

Zo všetkých mykobaktérií je komplex M. Avium-intracellularae najbežnejším pôvodcom pľúcnej mykobakteriózy u človeka. Spôsobuje choroby pľúc, periférnych lymfatických uzlín a rozšírených procesov. Na severe európskeho regiónu asi 60% mykobakteriózy pľúc. Vlákno-kavernózne a infiltračné procesy prevažujú s chronickým priebehom kvôli vysokej rezistencii na lieky proti tuberkulóze.

M. Kansasii sú pôvodcami chronického pľúcneho ochorenia, ktoré sa podobajú tuberkulóze. Chemoterapia je účinnejšia kvôli vyššej citlivosti M. Kansasii na antibakteriálne lieky. M. Xenopi a M. Malmoense spôsobujú hlavne chronické pľúcne ochorenia. Môžu znečistiť vodný systém teplej a studenej vody. Stanovisko M. Malmoens nie je úplne stanovené. M. Xenopi vykazujú pomerne dobrú citlivosť na terapiu proti tuberkulóze. M. Malmoense vykazujú dostatočne vysokú citlivosť na antibiotiká in vitro, ale konzervatívna liečba je často až do smrti neúčinná. M. Fortuitum a M. Chelonae rozpoznaný aktivátory kostí a mäkkých tkanív v dôsledku priamej infekcie rán, traumou, chirurgickým zákrokom, a preniká zranenia. Spôsobujú až 10% mykobakteriózy pľúc. To prúdi ako chronická, deštruktívna bilaterálna porážka, často smrteľná. Antituberkulózne lieky a širokospektrálne antibiotiká nie sú aktívne alebo nie sú veľmi účinné proti týmto typom mykobaktérií.

V južných oblastiach je mykobakterióza kože a mäkkých tkanív spôsobená M. Leprae, M. Ulceranse. Detekcia netuberkulóznych mykobaktérií sa vykonáva v laboratóriách vedúcich inštitúcií proti tuberkulóze krajiny. To vyžaduje vysokú kvalifikáciu a dobré vybavenie laboratórií.