Pri primárnej tuberkulóze sa lézie zvyčajne lokalizujú v lymfatických uzlinách, pľúcach, pohrudnici a niekedy aj v iných orgánoch: obličky, kĺby, kosti, peritoneum. Zóna špecifického zápalu môže byť veľmi malá a počas vyšetrenia zostáva skrytá. Pri veľkom poškodení sa zvyčajne vyskytuje počas klinických a radiačných vyšetrení pacienta.