Encefalitída pri ovčích kiahňach je závažné infekčno-alergické ochorenie. Encefalitída pri ovčích kiahňach sa vyvíja 3. až 7. deň po objavení sa vyrážky. Zriedkavo sa encefalitída vyskytuje neskôr alebo v období pred exantémom. Vyskytuje sa hypertermia, kóma, kŕče, meningeálne príznaky, pyramídové a extrapyramídové poruchy.