Pri vrodenej infekcii cytomegalovírusom závisí povaha postihnutého plodu od trvania infekcie. Akútne cytomegalovírusovej infekcie u matky v prvých 20 týždňoch tehotenstva môže viesť k závažným ochoreniam plodu, ktorého výsledkom sú spontánny potrat, fetálnu smrť, mortvorozhdenie, vady, vo väčšine prípadov, nezlučiteľné so životom. Po infekcie cytomegalovírus v neskorších fázach tehotenstva prognózy pre život a normálny vývoj dieťaťa, ktoré je výhodnejšie.