Liečba meningokokovej infekcie závisí od klinickej formy ochorenia. Pri nazofaryngitíde je liečba symptomatická. Ak je diagnóza potvrdené bakteriologicky použitý benzylpenicilín, ampicilín, cefalosporíny generovanie I-II, chloramfenikol, pefloxacín sekundárnych terapeutických dávkach počas 3 dní. Nepoužívajte kotrimoxazol, aminoglykozidy, pre ktoré je väčšina existujúcich meningokokových kmeňov stabilná.