Medzi zhubné nádory sú najčastejšie hepatoblastóm a hepatocelulárny karcinóm. Niekoľko kongenitálna anomálie sú pozorované zvýšené riziko nádorov pečene: hemihypertrophy, renálna agenéza alebo kongenitálna adrenálna Bekuita-Wiedemann syndrómom (organomegálii omfalokéla, makroglosia, hemihypertrophy), Meckelov divertikul. Nižšie sú uvedené choroby, pri ktorých sa tiež zvyšuje riziko vzniku pečeňových nádorov.