Aktivovaný proteín C štiepi faktory Va a VIIIa, čím inhibuje proces zrážania. Každá z niekoľkých mutácií faktora V spôsobuje jeho rezistenciu na aktivovaný proteín C, čím zvyšuje tendenciu k trombóze. Najčastejšou mutáciou faktora V je Leydenova mutácia. Homozygotné mutácie vo väčšej miere zvyšujú riziko trombózy ako heterozygotné.