Anomálie žlčových ciest a pečene môžu byť kombinované s inými vrodenými anomáliami, vrátane ochorenia srdca, polydaktívneho a polycystického ochorenia obličiek. Vývoj abnormalít žlčových ciest môže byť spojený s vírusovými infekciami u matky, napríklad s rubeolou.