Najčastejšou príčinou pyelonefritída - zástupcovia Entembacteriaceae rodina (gramnegatívne tyčinky), z ktorých coli účet Escherichia asi 80% (akútna nekomplikovaná prúd), aspoň ako budič vyčnievajú Proteus spp, Klebsiella spp, Enterobacter spp, Citrobacter spp ....