Symptómy malabsorpcie vitamínu B12 sa vyvíjajú od prvých mesiacov života dieťaťa. Zaznamenajú slabosť, bledosť, oneskorenie fyzického vývoja, hnačku. Po 6 až 30 mesiacoch od začiatku prvých príznakov sa zaznamenali neurologické poruchy: mentálna retardácia, neuropatia, myelopatia.