Aloimunitná alebo izoimunitná neutropénia novorodencov sa vyskytuje u plodu v dôsledku antigénnej inkompatibility neutrofilov plodu a matky. Izoanalýzy matky patria do triedy IgG, prenikajú do placentárnej bariéry a zničia neutrofilné dieťa. Isoantibodies sú zvyčajne leukoaglutiníny, reagujú s bunkami pacienta a jeho otca, nereagujú s bunkami matky.