Hlavný systém, ktorý metabolizuje lieky, sa nachádza v mikrozomálnej frakcii hepatocytov (v hladkom endoplazmatickom retikule). Zahŕňa monooxygenázy so zmiešanou funkciou, cytochróm C-reduktáza a cytochróm P450. Kofaktor je redukovaný NADPH v cytosole. Lieky sú podrobené hydroxylácii alebo oxidácii, ktoré poskytujú zvýšenie ich polarizácie. Alternatívnou reakciou fázy 1 je premena etanolu na acetaldehyd s použitím alkoholdehydrogenáz, ktoré sú detekované hlavne v cytosole.